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学术活动| 美国冷泉港实验室焦银平博士来我所做学术报告

发布时间:2018-04-16 发布来源:

 4月3日,应中国农业科学院农业基因组研究所所长黄三文的邀请,美国冷泉港实验室(Cold Spring Harbor Laboratory)焦银平博士来所进行学术交流,并做了题为“Decoding crop genomes for climate-smartagriculture”的报告。

 焦银平博士主要从事玉米和高粱基因组以及功能基因挖掘的研究,在此次学术报告中,焦博士向我们介绍了利用新一代PacBio长读长测序技术,重新构建了更详细精确的B73玉米基因组图谱。相对于以前的玉米基因组参考序列,本次得到的Contig长度增加了52倍,并且基因间和端粒区的组装效果明显得到了改善。焦博士对新一代玉米参考基因组的基因重复区的深入分析发现了130,000多个转座子元件,其中111,000个全长转录本的SMRT测序进一步更新了玉米基因组的注释信息。另外,焦博士还建立了高粱EMS突变体库,已经筛选到直立叶、褐色中脉、持绿性、大穗等许多有用的突变体。并对256个高粱EMS突变体全基因组测序,结合大数据和表达谱等信息整合,找到控制大穗性状关键基因Msd1。报告会后,我所相关领域科研人员与焦博士就复杂基因组组装的问题进行了深入交流讨论,并就后续合作提出了意向。

 焦银平博士毕业于中国农业大学,之后在冷泉港实验室开始博士后研究,以第一作者身份在《自然》(Nature)《自然·遗传》(Nature Genetics)《植物细胞》(The Plant Cell)《自然·通讯》(Nature Communications)等杂志上发表多篇高水平论文。