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熊兴耀课题组

课题组长

  熊兴耀,中国农业科学院(深圳)农业基因组研究所研究员,博士生导师,享受国务院特殊津贴专家,国家作物学会马铃薯专业委员会副主任,国家马铃薯产业技术创新联盟秘书长。本科和博士均毕业于湖南农业大学,1998~2003年在加拿大农业食品部(AAFC)马铃薯研究中心从事马铃薯遗传育种研究。2003年回国后,在湖南农业大学任园艺园林学院院长,园艺学一级学科博士学位点领衔人;2012年1月至2019年12月,在中国农业科学院蔬菜花卉研究所从事马铃薯栽培理论与技术研究,主持国家重点研发项目“马铃薯化肥农药减施关键技术模式研究与示范”等项目。2020年1月调入中国农业科学院深圳农业基因组研究所工作,加入合成生物学研究中心经济作物的全基因组设计育种团队,从事马铃薯栽培理论与技术研究,同时也开展品质性状的分子设计育种和块茎品质相关的组学研究。在Nature、 Nature Genetics、Plant Cell、the Plant Journal、Plant Breeding等杂志上发表SCI论文30余篇,获得国家发明专利授权60余项。获得省部级科技进步奖、自然科学奖和发明奖等10余项。先后多次应邀主持中国马铃薯大会,并多次应邀在国际国内马铃薯学术会议上做学术报告。培养博士研究生30余人、硕士研究生20余人,指导博士后研究人员10余人。

 

  工作经历

  1982.01-1991.02      湖南农学院园艺系果树教研室      教师

  1991.02-1992.05      湖南省永州市江永县人民政府      科技顾问

  1992.05-1993.06      湖南省农业高新技术开发总公司   副总经理

  1993.06-1998.07      湖南农业大学园艺系                    副教授

  1998.08-2003.02      加拿大农业部马铃薯研究中心      访学、博后、研究人员

  2003.03-2006.03      湖南农业大学园艺园林学院          院长、教授

  2006.03-2011.12      湖南省作物种质资源创新与资源利用重点实验室(国家重点实验室培育基地)    主任

  2012.01-2019.12      中国农业科学院蔬菜花卉研究所    教授

  2020.01--至今          中国农业科学院深圳农业基因组研究所   教授

  

  教育经历

  1978.03-1981.12      湖南农学院果树学                             学士

  1995.09-2000.08      湖南农业大学作物栽培学与耕作学      博士

  

  所获荣誉

  2006年   南方冬闲田马铃薯种植综合配套新技术研究与示范    湖南省科技进步奖    一等奖

  2010年   马铃薯安全食品加工新技术    湖南省技术发明奖    二等奖

  2012年   茉莉素信号传导的分子机理研究    湖南省自然科学奖    一等奖

  2013年   薯类酒精生产新技术及副产物综合利用    湖南省科技进步奖    二等奖

  2014年   南方马铃薯病毒病及种薯繁育技术研究与应用    湖南省科技进步奖    三等奖

  2016年   南方冬作适应型马铃薯新品种选育与推广    湖南省科技进步奖    三等奖

  

  研究内容

  马铃薯是最重要的块茎类粮食作物,生产主要是通过块茎无性繁殖,繁种技术复杂,容易感染病毒病,用种量巨大。受制于同源四倍体遗传的复杂性,马铃薯的遗传改良很慢。为了创新马铃薯的育种理论和方法,加快马铃薯的育种效率,改进种薯繁殖技术,降低种薯生产成本,团队开展了“优薯计划”(又称作“二倍体马铃薯杂交育种计划”),旨在将马铃薯由传统的四倍体块茎繁殖的作物改造成二倍体种子繁殖的作物。

  目前,团队围绕“优薯计划”开展了一系列的基础理论创新和育种实践,获得了马铃薯基因组图谱(Huang et al., Nature,2011),建立了国内最大的二倍体马铃薯种质资源库,通过基因组编辑的方法克服了二倍体马铃薯自交不亲和的难题(Ye et al., Nature Plants, 2018),并解析了马铃薯自交衰退的遗传基础(Zhang et al., Nature Genetics, 2019),已经培育出第一代二倍体马铃薯自交系和第一个概念性杂交种,为“优薯计划”的顺利开展奠定了基础。今后将继续开展“优薯计划”育种和配套栽培技术相关的研究工作,主要集中在:(1)马铃薯二倍体真种子的生长发育特性研究;(2)马铃薯二倍体真种子的重要农艺性状栽培技术研究与创新。

 

  Selected Publication

  1. Hou Q, Wang W X, Yang Y, Hu J, Bian C S, Jin L P, Li G C*, Xiong X Y*. Rhizosphere microbial diversity and community dynamics during potato cultivation . European Journal of Soil Biology, 2020, 98:103176. DOI:10.1016/j.ejsobi.2020.103176

  2. Qing Li, Yuzhi Qin, Xinxi Hu, Guangcun Li, Hongying Ding, Xingyao Xiong* &Wanxing Wang*. Transcriptome analysis uncovers the gene expression profile of salt-stressed potato (Solanum tuberosum L.). Scientific Reports, 2020, 10: 5411, https://doi.org/10.1038/ s41598-020-62057-0

  3. Qiulong Hu, Lin Tan, Xingxing Yang, Ye Deng, Songsong Gu, Jiren Chen, Liu Cai, Qian Zhou, Xinxi Hu, Yuzhi Qin and Xingyao Xiong*. The Divergence of Bacterial Communities among Continuous Cropping, Rotational Cropping and New Planting Potato Soils. Intl J Agric Biol., 2020, 23: 721–729

  4. Yixin Ye, Wen Dong, Yu Luo, Tony Fan, Xingyao Xiong, Liang Sun, Xinxi Hu,, Cultivar diversity and organ differences of cadmium accumulation in potato (Solanum tuberosum L.) allow the potential for Cd-safe staple food production on contaminated soils, Science of the Total Environment, 2019, https://doi.org/ 10.1016/j. scitotenv. 2019. 134534

  5. Yanlin Li*, Qing Yang, Xiaoying Yu, Li Wang, Wanxing Wang and Xingyao Xiong*. Induction of half-sib embryonic callus and production of taxiod compounds from Taxus chinensis var. mairei. Intl. J. Agric. Biol., 2019,21: 719‒725 

  6. Xiaohui Yang, Xiao Guo, Yu Yang, Pei Ye, Xingyao Xiong, Jun Liu, Daofeng Dong and Guangcun Li. Gene Profiling in Late Blight Resistance in Potato Genotype SD20. Int. J. Mol. Sci. 2018, 19, 1728; doi:10.3390/ijms19061728

  7. Helen H. Tai,* David De Koeyer, Mads Sønderkær, Sanne Hedegaard, Martin Lagüe, Claudia Goyer, Lana Nolan, Charlotte Davidson, Kyle Gardner, Jonathan Neilson, Jamuna Risal Paudel, Agnes Murphy, Benoit Bizimungu, Hui Ying Wang, Xingyao Xiong, Dennis Halterman, and Kåre Lehmann Nielsen. Verticillium dahliae Disease Resistance and the Regulatory Pathway for Maturity and Tuberization in Potato.The plant genome 2018, 11(1): 1-15

  8. Liu X., Liu Y., Huang P., Ma Y., Qing Z., Tang Q., Cao H., Cheng P., Zheng Y., Yuan Z., Zhou Y., Liu J., Tang Z., Zhuo Y., Zhang Y., Yu L., Huang J., Yang P., Peng Q., Zhang J., Jiang W., Zhang Z., Lin K., Ro D.-K., Chen X., Xiong X.*, Shang Y.*, Huang S*., and Zeng J.*. The Genome of Medicinal Plant Macleaya cordata Provides New Insights into Benzylisoquinoline Alkaloids Metabolism. Mol. Plant. 2017, 10:975–989.

  9. Xianfeng Ma, Wenming Wang, Florian Bittner, Nadine Schmidt, Robert Berkey, Lingli Zhang, Harlan King, Yi Zhang, Jiayue Feng, Yinqiang Wen, Liqiang Tan, Yue Li, Qiong Zhang, Ziniu Deng, Xingyao Xiong,* and Shunyuan Xiao.* Dual and Opposing Roles of Xanthine Dehydrogenase in Defense-Associated Reactive Oxygen Species Metabolism in Arabidopsis. The Plant Cell, 2016, 28(5): 1108–1126.

  10. Xinxi Hu, Virginia Dickison, Yan Lei, Changzheng He, Mathuresh Singh, Yanli Yang, Xingyao Xiong & Xianzhou Nie. Molecular characterization of Potato moptop virus isolates from China and Canada and development of RT-PCR differentiation of two sequence variant groups. Can. J. Plant Pathol., 2016 .38( 2): 231–242.

  11. Hongqi Xie,Wei Luo, Dongbo Liu, Xingyao Xiong*. Preparation and Adsorption Characteristics of Cordycepin Moleculary Imprinted Polymers. Analytical Letters, 2014, 47 (11): 1888-1899.

  12. He, C., Zhang, W., Hu, X., Singh, M., Xiong, X., & Nie, X. Molecular characterization of a Chinese isolate of potato virus A (PVA) and evidence of a genome recombination event between PVA variants at the 3′-proximal end of the genome. Archives of virology 2014, 1-6.

  13. Jianguo Zeng, Yisong Liu, Wei Liu ,Xiubing Liu, Fuqing Liu, Peng Huang, Pengcheng Zhu, Jinjun Chen, Mingming Shi, Fang Guo Pi Cheng, Jing Zeng, Yifang Liao, Jing Gong, Hong-Mei Zhang, Depeng Wang, An-Yuan Guo, Xingyao Xiong*. Integration of Transcriptome, Proteome and Metabolism Data Reveals the Alkaloids Biosynthesis in Macleaya cordata and Macleaya microcarpa. PLos ONE 2013,8(1): e53409. 

  14. Jianjian Qi, Xin Liu, Di Shen, Han Miao, Bingyan Xie, Xixiang Li, Peng Zeng, Shenhao Wang, Yi Shang, Xingfang Gu, Yongchen Du, Ying Li, Tao Lin, Jinhong Yuan, Xueyong Yang, Jinfeng Chen, Huiming Chen, Xingyao Xiong, Ke Huang, Zhangjun Fei, Linyong Mao, Li Tian, Thomas Staedler, Susanne S. Renner, Sophien Kamoun, William J Lucas., Zhonghua Zhang†, Sanwen Huang†, A Genomic Variation Map Provides Insights into the Genetic Basis of Cucumber Domestication and Diversity, Nature Genetics, 2013,45, 12, 2013: 1510-1515

  15. Huiying Wang, Mingyue Liu, Xinxi Hu, Mei Li and Xingyao Xiong*. Electrochemical Determination of Glycoalkaloids Using a Carbon Nanotubes-Phenylboronic Acid Modified Glassy Carbon Electrode. Sensors 2013, 13, 16234-16244; doi:10.3390/s131216234

  16. Dongbo Liu., Jing Gong, Wenkui Dai., Xincong Kang., Zhuo Huang, Hong-Mei Zhang, Wei Liu, Le Liu, Junping Ma, Zhilan Xia, Yuxin Chen, Yuewen Chen, Depeng Wang, Peixiang Ni, An-Yuan Guo*and Xingyao Xiong*. The Genome of Ganderma lucidum Provide Insights into Triterpense Biosynthesis and Wood Degradation. PLOS ONE,2012, 7(5):e36146.

  17. Wen-Ming Wang, Xian-Feng Ma, Yi Zhang, Ming-Cheng Luo, Guo-Liang Wang, Maria Bellizzi, Xing-Yao Xiong and Shun-Yuan Xiao. PAPP2C Interacts with the Atypical Disease Resistance Protein RPW8.2 and Negatively Regulates Salicylic Acid-Dependent Defense Responses in Arabidopsis. Molecular Plant. 2012 ,(2): 1-13.

  18. Bernie J. Zebarth, Helen Tai, Sainan Luo,Pete Millard, David De Koeyer, Xiu-Qing Li and Xingyao Xiong. Effect of Nitrogen Form on Gene Expression in Leaf Tissue of Greenhouse Grown Potatoes During Three Stages of Growth,Am. J. Pot Res,2012, DOl10.1007/ s12230-012-9255-2

  19. Xun Xu, Shengkai Pan, Shifeng Cheng, Bo Zhang, Desheng Mu, Peixiang Ni, Gengyun Zhang, Shuang Yang, Ruiqiang Li, Jun Wang, Gisella Orjeda, Frank Guzman, Michael Torres, Roberto Lozano, Olga Ponce, Diana Martinez, German De la Cruz, S. K. Chakrabarti, Virupaksh U. Patil, Konstantin G. Skryabin, Boris B. Kuznetsov, Nikolai V. Ravin, Tatjana V. Kolganova, Alexey V. Beletsky, Andrei V. Mardanov, Alex Di Genova, Daniel M. Bolser, David M. A. Martin, Guangcun Li, Yu Yang, Hanhui Kuang, Qun Hu, Xingyao Xiong, Gerard J. Bishop, Boris Sagredo, Nilo Mejia, Wlodzimierz Zagorski, Robert Gromadka, Jan Gawor, Pawel Szczesny, Sanwen Huang†, Zhonghua Zhang,Chunbo  Liang, Jun He, Ying Li, Ying He, Jianfei Xu, Youjun Zhang, Binyan Xie, Yongchen Du, Dongyu Qu, Merideth Bonierbale, Marc Ghislain,, Maria del Rosario Herrera, Giovanni Giuliano, Marco Pietrella, Gaetano Perrotta, Paolo Facella, Kimberly O'Brien, Sergio E. Feingold, Leandro E. Barreiro, Gabriela A. Massa, Luis Diambra, Brett R. Whitty, Brieanne Vaillancourt, Haining Lin, AliciaN. Massa, Michael Geoffroy, Steven Lundback, Dean DellaPenna, C. Robin Buell†, Sanjeev Kumar Sharma, David F. Marshall, Robbie Waugh, Glenn J. Bryan, Marialaura Destefanis, Istvan Nagy, Dan Milbourne, Susan J. Thomson, Mark Fiers, Jeanne M. E. Jacobs, Kare L. Nielsen, Mads Sonderkaer, Marina Iovene, Giovana A. Torres, Jiming Jiang, Richard E. Veilleux, Christian W. B. Bachem, Jan de Boer, Theo Borm, Bjorn Kloosterman, Herman van Eck, Erwin Datema, Bas Te Lintel Hekkert, Aska Goverse, Roeland C. H. J. van Ham, Richard G. F. Visser†, Genome Sequence and Analysis of the Tuber Crop Potato, Nature, 2012,475, 7355, 2011: 189-195

 

  Selected Patent

  1. 一种在冬闲田种植马铃薯的方法,国家发明专利: ZL200510031892.2

  2. 一种非油炸型速冻马铃薯食品及其加工方法,国家发明专利: ZL200510031840.5

  3. 一种马铃薯冬闲稻田专用控释复混肥,国家发明专利:ZL200510031891.8

  4. 一种从刺葡萄种籽中提取刺葡萄籽油的方法,国家发明专利: ZL200510031719.2

  5. 一种从西番莲种籽中提取西番莲籽油的方法,国家发明专利: ZL200510031720.5

  6. 一种马铃薯淀粉虾片及其加工方法,国家发明专利: ZL200510031837.3

  7. 一种利用微波加工的马铃薯脆片及其加工方法,国家发明专利: ZL200510031838.8

  8. 一种挤压膨化马铃薯全粉食品及其加工方法,国家发明专利: ZL200510031839.2

  9. 一种利用马铃薯生产酒精的方法,国家发明专利: ZL200710035241.X

  10. 一种固体燃料乙醇及其制备方法,国家发明专利,公开号:CN101338234

  11. 一种淀粉快速液化糖化的方法,国家发明专利,公开号: CN101280331

  12. 无籽西瓜种子自动破壳机,国家发明专利: ZL200710034769.5

  13. 一种薯条切割机,实用新型专利: ZL200620051354.X

  14. 可调节定量手动施肥器,实用新型专利: ZL200820053485.0

  15. 机动秸秆粉碎机,实用新型专利: ZL201020300895.8

  16. 可调节简易修剪装置,实用新型专利: ZL200720062994.5

  17. 从发酵醪液中气相吸附生产无水乙醇的方法,国家发明专利,公开号: CN101891590A

  18. 利用薯类酒糟生产微生物饲料添加剂的方法,国家发明专利,公开号: CN101897381A

  19. 用薯类酒糟生产商品有机肥的方法,国家发明专利,公开号: CN101891510A

  20. 一种酶解吸附脱水剂及其制备方法,国家发明专利,公开号: CN101905147

  21. 一种吸附法生产乙醇用的脱水吸附剂及其制备方法,国家发明专利,公开号: CN101879437A 

  22. 柑橘活性成分的萃取方法,国家发明专利,公开号: CN101390975

  23. 从蛹虫草中连续提取虫草挥发油、虫草素、虫草酸与虫草多糖的工艺,国家发明专利,公开号:CN101580755

  25. 芦苇纤维快速降解制糖的方法,国家发明专利,申请号: 201010512869.6

  26. 马铃薯覆草机,国家发明专利,申请号: 20910304490.3

  27. 基于PCR的串联重复序列快速构件法和专用引物对及应用,国家发明专利,公开号:CN102154269

  28. 一种白背三七的快繁方法, 国家发明专利,公开号:CN102144569

  29. 悬浮共培养将人参总DNA导入马铃薯单细胞的方法,国家发明专利,公开号:CN102124949

  30. 一种提高三倍体无籽西瓜种子萌发率的方法,国家发明专利:ZL201010586900.0

  31. 一种利用变温脱毒技术生产马铃薯pva脱毒苗的方法,国家发明专利,公开号:CN102017895

  32. 抗旱自动浸灌营养植物饲料袋,国家发明专利,公开号:CN201630095

  33. 一种柑橘成年态节间茎段遗传转化方法,国家发明专利,公开号:CN101250549

  34. 机动秸秆粉碎机,国家发明专利,公开号:CN201585276

  35. 一种白背三七的组织培养方法,国家发明专利:ZL201110115842.8

  36. 芦苇纤维快速降解制糖的方法,国家发明专利:ZL201010512869.6

  37. 一种发酵型虫草花米乳饮料的制备方法,国家发明专利:ZL201210064899.4

  38. 一种赤芝多糖营养甜酒及制作工艺,国家发明专利:ZL201210302393.2

  40. 一种月月红体细胞胚胎发生及植株再生方法,国家发明专利:ZL20120434709.3

  41. 一种红豆杉成熟胚乳诱导单倍体胚乳愈伤组织的方法,国家发明专利:ZL201210203083.5

  42. 一种红豆杉试管苗诱导获得愈伤组织和悬浮细胞的方法,国家发明专利:ZL201210201777.5

  43. 一种诱导红豆杉种子种胚获得愈伤组织和悬浮细胞的方法,国家发明专利:ZL201210201775.6

  44. 一种快速打破南方红豆杉种子休眠的方法,国家发明专利:ZL201210201360.9

  45. 从发酵醪液中气相吸附生产无水乙醇的方法,国家发明专利:ZL201010245025X

  46. 一种鱼腥草快速繁殖的方法,国家发明专利:ZL201210323739.7

  47. 一种四重RT-PCR同时检测多种大蒜病毒的方法及其引物组合,国家发明专利,ZL201410092027.8

  48. 一种马铃薯α-茄碱提取与检测的方法,国家发明专利,ZL201210321390.3

  49. 一种大田马铃薯植株氮素营养分子诊断方法及其在施肥上的应用,国家发明专利,ZL201410094874.8

 

熊兴耀课题组更新于2020年7月

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