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博士后招聘| 基因组所合成生物学研究中心程时锋课题组诚招博士后

来源: 发布者: 时间:2020年05月07日

  基因组所介绍

  中国农业科学院(深圳)农业基因组研究所(简称“基因组所”),是中国农业科学院和深圳市共同举办的新型国家级研究所,以生物组学为核心,辐射农业、食品与健康、生态与环境等三大领域,按照学科集群成立了组学技术、合成生物学、植物基因组、动物基因组、生态基因组等5个研究中心。成立四年来,践行“跃居世界农业科技高端,服务产业重大科技需求”国家使命,服务于粤港澳大湾区战略部署和深圳市国际科技产业创新中心建设,打造了国际领先的“种质资源收集 — 基因组测序和分析 — 功能基因挖掘 —分子设计育种”的全链条创新平台;引进了32位具有国际竞争力的PI,累计招收博士后101名;总经费超过4亿元;在农业生物组学基础、基因组学与动植物分子育种、基因组学与动植物健康等方向取得了突出成果,在Science、Nature、Cell、Nature Genetics等知名期刊上发表SCI论文200余篇,奠定了我国农业基因组学的国际地位;力争用10年左右时间实现“建设世界一流院所、建成国家农科特区、发展深圳生物产业、支撑湾区美好生活”的发展目标。

  

  程时锋课题组简介

  中国农业科学院(深圳)农业基因组研究所(简称“基因组所”)合成生物学研究中心程时锋课题组致力于利用比较进化基因组学和群体遗传学关联分析,以研究“植物/作物关键(演化或农艺)性状起源和分子机制”。在进化基因组学方面,从植物大进化的纵向比较方面,研究植物生物多样性基因组及性状起源(如新器官多样性辐射、深度同源与趋同进化等)及关键进化节点中基因组结构、功能与适应性分子机制;在作物群体遗传学方面,重点关注GWAS关联分析和基因挖掘,包括kmer-based GWAS,PAV/SV-GWAS, eGWAS, mGWAS等,同时开发pan-genome构建、Pan-NLRome基因多样性挖掘等一系列生物信息学技术流程和算法。  

  近几年特别关注:(1)结瘤生物固氮分支(N-fixingnodulation clade)中RootNodule Symbiosis祖先起源与平行演化的基因组多样性和表达表观等方面的机制;(2)禾本科作物和豆科豆类群体遗传学。团队先后参与完成了多个重大组学项目,相关研究结果发表在Cell、Science、Nature Genetics、Nature Biotechnology、Gigascience、Plant Cell、Plant Journal等知名国际期刊上。目前拥有团队成员12名,主要来自计算机科学、基因组学、生物信息学、植物分子生物学、进化与群体遗传学等多个学科。

 

  01 招聘需求

  1.   植物基因组和生物信息学大数据分析算法开发博士后1名;
  2.   植物比较进化基因组学与趋同演化机制研究博士后1名;
  3.   结瘤共生生物固氮演化与遗传调控网络构建博士后1名;
  4.   植物与共生微生物互作基因组多样性与适应性演化博士后1名;
  5.   复杂多倍体作物群体多样性与重要农艺功能基因挖掘博士后1名;
  6.   植物基因组非编码调控元件鉴定(结合RNA-seq、Chip-seq、ATAC-seq等多组学技术)及生物信息分析流程搭建博士后1名。

  

  02 岗位职责

  研究工作包括:

  1.   揭示结瘤共生生物固氮分支植物基因组与遗传创新的起源、演变和网络调控的分子机制,为豆科生物固氮能力工程化转嫁到大多数经济农作物提供线索;
  2.   开发和构建比较系统进化基因组(Phylogenomics)、调控基因组学和单细胞组学等技术,将“进化+组学”科研策略应用在“深度同源”与“趋同进化”的植物特征性状的Evo-Devo研究中(如C4光合作用),为研究植-菌互作的起源、平行演化、和遗传发育提供了重要的技术手段;
  3.   作物群体遗传多样性与适应性农艺性状的进化与驯化机制研究,开发复杂多倍体比较群体基因组学分析技术,基于课题组拥有的测序大数据和种质资源,进一步优化或开发SNP-based GWAS, kmer-basedGWAS, PAV/SV-GWAS, 以及eGWAS, mGWAS等分析技术;
  4.   阐明微生物共生和互作在塑造植物/农作物基因组结构、功能和长期适应性中的作用,特别是作物氮/磷吸收、利用方面的分子机制。构建植物和土壤共生微生物大尺度基因组起源与演化范式,特别研究豆科、禾本科共生微生物多样性与适应性机制。

  

  03 应聘条件

  1.   博士学位,基因组学与生物信息学、计算机、进化生物学、分子生物学、生物化学、遗传育种或生物统计等相关专业;
  2.   良好的沟通能力和中英文科技写作能力;
  3.   不超过35周岁,近3年在国际学术刊物以第一作者发表过或即将发表SCI论文。

  

  04 岗位待遇

  ➤  博士后待遇(三年综合收入约100万元,具体以最新政策为准)

  1.   在站期间享受深圳市和大鹏新区的在站博士后生活补贴,共计税后60万元;
  2.   按照研究所的相关规定提供博士后的工资、五险一金和绩效待遇;
  3.   博士后人员进站后,可选择落户深圳市,其配偶及未成年子女可办理随迁入户,并且享受深圳市和大鹏新区的新引进人才生活补贴,共计税后6万元;
  4.   博士后在站期间鼓励申报中国博士后基金、国家自然科学青年基金,项目结题且出站后留深工作的可认定为深圳市后备级高层次人才,奖励160万,若在大鹏新区工作,另有1:1配套补贴。
  5.   深圳市博士后政策及出站后留深待遇介绍:
  6.   http://hrss.sz.gov.cn/xxgk/zcfgjjd/zcfg/rcfw/202004/t20200420_19178667.htm
  7.   http://www.dpxq.gov.cn/xxgk/xxgk/zfwj/201905/t20190531_17857395.htm
  8.   http://hrss.sz.gov.cn/xxgk/qtxx/gzdt/201708/t20170831_8317471.htm

  

  岗位申请方式

  •   申请者请将个人简历(包含教育经历、研究经历、论文发表)、代表作和研究意向以电子邮件形式发送至:chengshifeng@caas.cn,邮件主题和材料压缩文件请注明“姓名+申请博士后”。
  •   研究所会仔细分析并保密所有申请资料,并在收到申请的一个月内与初审合格者电话或E-mail联系,安排面试;资格审查未通过者,不再另行告知。

  

  程时锋代表论文

  1.   Cheng S*, Xian W, Fu Y, et al. Genomes of SubaerialZygnematophyceae Provide Insights into Land Plant Evolution. Cell, 2019,179(5): 1057-1067. e14.  
  2.   Griesmann M, Chang Y, Liu X, et al. Cheng S†. Phylogenomicsreveals multiple losses of nitrogen-fixing root nodule symbiosis[J]. Science,2018, 361(6398): eaat1743.  
  3.   Cheng S*, Melkonian M, Smith SA, et al. 10KP: Aphylodiverse genome sequencing plan. Gigascience. 2018;7(3):1–9.  
  4.   Cheng S*, Gutmann B, Zhong X, et al. Redefining thestructural motifs that determine RNA binding and RNA editing bypentatricopeptide repeat proteins in land plants. Plant J.2016;85(4):532–547.  
  5.   Lin S, Cheng S*, Song B, et al. The Symbiodiniumkawagutii genome illuminates dinoflagellate gene expression and coral symbiosis. Science.2015;350(6261):691–694.  
  6.   Cheng S*, van den Bergh E, Zeng P, et al. TheTarenaya hassleriana genome provides insight into reproductive trait and genomeevolution of crucifers. Plant Cell. 2013;25(8):2813–2830.  
  7.   Zhang, G., Liu, X., Quan, Z. Cheng S*. et al. Genomesequence of foxtail millet (Setaria italica) provides insights into grassevolution and biofuel potential. Nat Biotechnol 30, 549–554 (2012).

  

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