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宋波

  宋波副研究员

  中国农业科学院(深圳)农业基因组研究所

  深圳市大鹏新区鹏飞路7号 邮编:518124

  Email: songbo01@caas.cn

  出生时间:1984年11月18日

  出生地点:湖北赤壁

 

  学习经历

  2006.9-2013.6     华中农业大学作物生物技术专业,获博士学位

  2002.9-2006.6     华中农业大学植物保护专业,获学士学位

 

  工作经历

  2019.5-至今            中国农业科学院农业基因组研究所  副研究员

  2016.10-2019.4      深圳大学  博士后

  2013.7-2016.9        深圳华大基因研究院  生物信息研究员

 

  宋波副研究员致力于生物信息学和动植物基因组学研究,参与或主导完成了虫黄藻、红茄、蛇蜥等多个基因组测序或重测序项目,致力于全球粮食作物,特别是小作物的基因组和遗传多样性研究。深入研究植物翻译组和小RNA序列,独立开发蛋白编码框预测工具,并将其运用到水稻和小麦等作物的研究中。研究工作获国家自然基金(青年基金)和中国博士后科学基金面上项目(一等)的资助,先后发表SCI研究论文20余篇,其中第一作者或通讯作者8篇,申请发明专利3项。

 

  部分论文:

  1. Li T.(#), Yu L.(#), Song B.(#), Song Y., Li L., Lin X.(*), Lin S.(*) Genome Improvement and Core Gene Set Refinement of Fugacium kawagutii. Microorganisms. 2020. 8(1): 102

  2. Song J.(#), Wang X.(#), Song B., Gao L., Mo X., Yue L., Yang H., Lu J., Ren G., Mo B.(*), Chen X.(*). Prevalent cytidylation and uridylation of precursor miRNAs in Arabidopsis. Nature Plants. 2019. 5: 1260-1272

  3. Wang S.(#), Li L.(#), Li H., Sahu S., Wang H., Xu Y., Xian W., Song B., Liang H. et al. Genomes of early-diverging streptophyte algae shed light on plant terrestrialization. Nature Plants. 2019. 4531

  4. Song B.(#), Song Y.(#), Fu Y.(#), Kizito E. B., Kamenya S. N., Kabod P. N. et al. Draft genome sequence of Solanum aethiopicum provides insights into disease resistance, drought tolerance, and the evolution of the genome. GigaScience. 2019. 8(10): giz115

  5. Song Y.(#), Zaheri B.(#), Liu M., Sahu S. K., Liu H., Chen W., (*), Song B.(*), Morse D.(*). Fugacium Spliced Leader Genes Identified from Stranded RNA-Seq Datasets. Microorganisms. 2019. 7(6): 171

  6. Song B., Chen S. and Chen W. Dinoflagellates, a unique lineage for retrogene research. Frontiers in Microbiology. 2018. 9:1556

  7. Song B., Morse D., Song Y., Fu Y. et al., Comparative genomics reveals two major bouts of gene retroposition coinciding with crucial periods of Symbiodinium evolution. Genome Biology and Evolution. 2017. 9(8): 2037-2047

  8. Lin S.(#), Cheng S.(#), Song B.(#) et al. The Symbiodinium kawagutii genome illuminates dinoflagellate gene expression and coral symbiosis. Science. 2015. 350: 691-694

  9. Song B., Cheng S. et al. A genome draft of the legless anguid lizard, Ophisaurus gracilis. GigaScience. 2015,4: 17

  10. Song, B., Li, H.-P., Zhang, J.-B. et al. Type II myosin gene in Fusarium graminearum is required for septation, development, mycotoxin biosynthesis and pathogenicity. Fungal Genetics and Biology, 2013, DOI: 10.1016/j.fgb.2013.02.010.

  

  专利

  一种从低质量核糖体印迹数据预测基因编码框的方法和系统,莫蓓莘、宋波、高雷、陈雪梅,专利申请号:201910407961.7

  一种高质量水稻核糖体印记文库的构建方法,刘琳、杨晓玉、崔洁、宋波、陈雪梅、莫蓓莘,专利申请号:201910376020.1

  一种高效获取叶绿体DNA 测序数据的方法及其应用, 宋跃,宋波,符渊,刘欢,程时锋,刘心,专利申请号:201810040063.8

  

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