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程旭课题组

课题组组长

程旭,研究员(PI),深圳市海外高层次人才。2016年博士毕业于荷兰瓦赫宁根大学。长期从事土壤和根际微生物组相关的科研工作,研究领域主要包括微生物-植物-环境的相互作用,微生物群落的结构组成和功能分析,以及微生物菌株和复合微生物菌群促进植物生长和提高植物逆境耐受能力的作用机制。目前,发表论文16篇,其中以第一作者(含共同)和通讯作者(含共同)身份在The ISME JournalEnvironmental Microbiology以及Environmental Microbiology Report等国际学术期刊上发表学术论文6篇,获得授权国家专利5项。联系方式:chengxu@caas.cn


工作经历

2022/04 至今 中国农业科学院深圳农业基因组研究所 研究员(PI)

2021/12 – 2022/03      中国农业科学院深圳农业基因组研究所            Pre-PI

2020/06 – 2021/08      荷兰瓦赫宁根大学                                  Guest Scientist

2014/06 – 2020/05      荷兰瓦赫宁根大学 博士后

2013/10 – 2014/02      美国加州大学圣地亚哥分校 访问学者

2009/01 – 2009/07      美国康奈尔大学 研究助理


教育经历

2010/03 – 2016/09     荷兰瓦赫宁根大学 博士研究生

2003/12 – 2009/08     荷兰瓦赫宁根大学 学士和硕士研究生

2001/09 – 2003/08     中国农业大学 本科


团队研究方向

(一)作物栽培学。本课题组目前以马铃薯为主要材料,专注于促进杂交二倍体马铃薯种子萌发和育苗壮苗技术的研发和创新;通过土壤改良、水-肥-药一体化的栽培和管理技术研发和创新,从而提高杂交马铃薯产量和品质。

(二)土壤和植物微生物组学。土壤和植物根系存在着成千上万种微生物,具有丰富的多样性,并与植物的生长和健康息息相关。本课题组将通过宏扩增子、宏基因组结合代谢组等多组学技术深入研究马铃薯根系微生物组组成结构、丰度和功能;通过分析核心和基石类菌群等,构建复合微生物群落,揭示其对马铃薯促生和提高逆境胁迫能力的作用机理。


Selected publications

1. Lucas Schmitz, Zhichun Yan, Martinus Schneijderberg, Martijn de Roij, Rick Pijnenburg, Qi Zheng, Carolien Franken, Annemarie Dechesne, Luisa M. Trindade, Robin van Velzen1, Ton Bisseling, Rene Geurts*, and Xu Cheng* (2022). A synthetic bacterial community derived from a desert rhizosphere confers salt stress resilience to tomato in the presence of a soil microbiome. The ISME J. (In press) (*Co-corresponding authors)

2. Schneijderberg M, Cheng X.*, Franken C., de Hollander M., van Velzen B., Schmitz L., Geurts R., van der Putten W.H., Bezemer T.M. and Bisseling T.* (2020). Quantitative comparison between the rhizosphere effect of Arabidopsis thaliana and co-occurring plant species with a longer life history. The ISME J. 14: 2433–2448. (*Co-corresponding authors)

3. Cheng X, Etalo DW, van de Mortel JE, et al. (2017). Genome-wide analysis of bacterial determinants of plant growth promotion and induced systemic resistance by Pseudomonas fluorescens. Environ Microbiol., 19(11):4638-4656.

4. Cheng X, Cordovez V, Etalo DW, van der Voort M, Raaijmakers JM. (2016). Role of the GacS Sensor Kinase in the Regulation of Volatile Production by Plant Growth-Promoting Pseudomonas fluorescens SBW25. Front Plant Sci., 7:1706.

5. Cheng, X., van der Voort, M. & Raaijmakers, J. M. (2015). Gac-mediated changes in pyrroloquinoline quinone biosynthesis enhance the antimicrobial activity of Pseudomonas fluorescens SBW25. Environ Microbiol Rep., 7, 139–147.

6. Cheng X., Irene de Bruijn, Menno van der Voort, Joyce E. Loper and Jos M. Raaijmakers (2013). The Gac Regulon of Pseudomonas fluorescens SBW25. Environ Microbiol Rep., 4,608-19.



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