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樊伟

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      樊伟,研究员,博士生导师,入选中国农科院“青年英才”,深圳市国家级领军人才。致力于基因组学和生物信息学研究,主要学术成果包括:首次利用第二代测序技术完成大熊猫基因组研究,首次利用单细胞测序技术完成人类精子和卵子细胞基因组研究,首次在国际上完成了鸡肠道宏基因组系统研究。研究成果发表于Nature、Science、Cell、Bioinformatics、Microbiome等国际期刊,累计他引3000次以上。(联系方式:fanwei@caas.cn)

  工作经历

  2015.7-至今             首席科学家,中国农业科学院深圳农业基因组研究所

  2005.7-2011.2         科研项目负责人,华大基因研究院

  教育经历

  2001.9-2005.6           理学学士           南开大学

  2012.9-2015.6           理学硕士           北京大学  

  研究方向

  团队研究方向包括与基因组紧密相关的生命科学问题研究,有显著农业应用价值物种的基因组学研究,以及开发解决基因组学前沿问题的生物信息学算法软件。利用基因组学与生物信息学技术推动生物育种和病虫害防治等领域的重大变革。 

  研究进展

  1. 基因组学研究:已经完成生殖细胞精子和卵子单细胞基因组研究,揭示了个体水平上的减数分裂重组规律和非整倍体的发生规律,该成果将促进生殖细胞的筛选、优生优育和生物育种领域的发展;已经完成大熊猫、薇甘菊、多头带绦虫、福寿螺、非洲大蜗牛、绿盲蝽等多种生物的基因组学研究,揭示了这些物种的独特表型背后的基因组遗传机制,为这些物种的持续开发利用奠定基础。已经完成鸡肠道微生物、沼气微生物等宏基因组学研究,构建了核心微生物的基因组和基因集,为进一步选育有益菌铺平道路。 

  2. 生物信息学研究:已经开发测序数据特征分析与精准模拟算法 (PIRS)、基于Kmer的基因组特征估计算法(GCE)、二代短序列组装算法(DBG)、单细胞变异检测和重组位点检测算法(SPERMSNP)、同源基因定位算法(FGF)等多个生物信息学算法软件。这些算法软件在生物信息学领域具有一定的影响,促进了一系列基因组研究项目的开展,软件代码开源在Github (https://github.com/fanagislab)。 

       主要讲授课程:组学数据统计分析。