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在希望的田野上,书写我们的梦想

夏日炎炎,广袤田野生机盎然。麦田里,成熟的麦穗在阳光的照射下显得格外金黄,瓜田里,碧绿的西瓜已成熟落蒂,在这个成熟与收获的季节,基因组所深圳研究生院的莘莘学子也将从田野里出发,走向广阔的人生。


这个毕业季,我们邀请了三位毕业生代表,与我们共同分享他们在基因组所的成长故事和他们在田间的追梦之旅。


胡勇:“做一个新时代农民”

姓名:胡勇

研究方向:生物信息整合与模拟

导师:黄三文

发表论文情况:以共同第一作者在Cell上发表论文一篇

[1] WU Y*, LI D*, HU Y*, LI H, RAMSTEIN G P, ZHOU S, ZHANG X, BAO Z, ZHANG Y, SONG B, ZHOU Y, ZHOU Y, GAGNON E, SÄRKINEN T, KNAPP S, ZHANG C, STÄDLER T, BUCKLER E S, HUANG S#, 2023. Phylogenomic discovery of deleterious mutations facilitates hybrid potato breeding. Cell [J]. DOI: 10.1016/j.cell.2023.04.008. (共同第一作者)

毕业去向:留所读博



我从小在农村长大,我的父母都是农民。每当农忙的时候,放学后我就得立刻回家帮忙干活。有一次,我们割稻子割到了晚上8点,我感到又饿又累,腰都直不起来了。那时候,农用机械还没有普及,我们村里也没有割稻机,只能靠人工一点点地割。后来,我们终于有了割稻机,几个人的工作在不到1个小时内就完成了,那是我第一次对科技改变农业有了深刻的印象。


之后,出于对农业的兴趣,我选择了学习生物专业。在南京农业大学毕业后,我决定来深圳农业基因组研究所深造,并成为了深圳研究生院成立后的第一届研究生。我有幸加入了黄三文课题组从事生物信息学的研究。课题组就像一个大家庭,大家相互学习和成长,在学术交流中相互启发,在相处中建立了深厚的友谊。


在导师黄三文研究员和吴瑶瑶师姐的指导下,我参与了关于马铃薯有害突变的项目,并于2023年5月以共同第一作者在Cell杂志上发表了题为《Phylogenomic discovery of deleterious mutations facilitates hybrid potato breeding》的研究论文。在研究所的三年时间里,我结识了许多朋友,我们一起分享科研的乐趣和挑战,也一起玩游戏、聊天、放松身心。这让我的生活充满了乐趣和色彩。研究所提供了强大的导师团队、浓厚的学术氛围和优良的科研条件,这让我决定留在研究所继续攻读博士学位。


我将一如既往地以解决问题为导向,继续为科学研究做出贡献。我相信在基因组所的学习和研究中,我会取得更多的成果,并为推动农业科学的发展做出自己的贡献。




张广忠:"只要不放弃,终点总会到达"

姓名:张广忠

研究方向:入侵植物的生物防控

导师:万方浩、钱万强课题组

发表论文情况:以第一作者在SCI一区Plant physiology发表论文一篇;以共同第一作者在SCI二区期刊Microorganisms发表论文一篇;专利一篇。

[1] Guangzhong Zhang†, Chenjiaozi Wang†, Xinghai Ren, Zaiyuan Li, Conghui Liu, Xi Qiao, Shicai Shen, Fudou Zhang, Fanghao Wan, Bo Liu*,Wanqiang Qian1* 2023, Inhibition of the rapid growth of invasive plant Mikania micrantha by host-specific rust (Puccinia spegazzinii). Plant physiology DOI: 10.1093/plphys/kiad186 (第一作者,SCI一区)

[2]Xinghai Ren †, Guangzhong Zhang †, Mengjiao Jin, Fanghao Wan, Michael D. Day, Wanqiang Qian * and Bo Liu* 2023,Metabolomics and Transcriptomics Reveal the Response Mechanisms of Mikania micrantha to Puccinia spegazzinii infection. Microorganisms DOI:10.3390/microorganisms11030678 (共一第二作者,SCI二区)

[3]一种抑制薇甘菊快速生长的生物方法 发明人:钱万强;刘博;张广忠;乔曦;申时才;万方浩(专利号:ZL 2022 1 0230108.4)

毕业去向:南开大学攻读博士学位


我的研究方向是入侵生物学,主要研究非本地物种对新环境的适应和影响,生物入侵是一个全球性的挑战,了解生物入侵的机制和后果,对于制定有效的保护策略至关重要,能为保护本地生物多样性提供解决方案,在学习入侵生物学的过程中,我获得了许多宝贵的感悟和收获,学习到了最新的研究方法和技术,并得以参与到实际生物防治的项目中。三年的科研经历培养了我深入思考和分析问题的能力,它要求我不断提出问题,以问题导向设计实验、收集数据和分析结果,有时,实验结果并不如预期,需要不断调整实验方法,印象最深刻的是,我的论文从投稿到接收经历了漫长的修改和调整,历程6个月的努力,终于得以成功发表,这个过程培养了我耐心和坚持的品质,我学会了从失败中学习,不断改进方法和实验设计。


作为一名研究生,我对未来充满期待和憧憬。我深知研究生阶段只是我科研生涯的起点,我希望能够在未来的道路上继续努力并取得更大的成就。我想对未来自己说一句寄语:坚持不懈,追求卓越。在科研道路上,困难和挑战是难以避免的,但只要我们保持激情和毅力,坚持自己的梦想,就一定能够取得成功。




许亚苹:"研究是对未知领域和未知世界的探索"

姓名:许亚苹

专业:农艺与种业

中心:组学中心

导师:阮珏

获奖情况:优秀毕业生、中国农业科学院研究生院社会活动优秀奖、“深圳青年五四奖章”集体成员

毕业去向:科研助理


在硕士期间,我的研究方向是DNA存储的编解码优化设计,属于BT(生物技术)和IT(信息技术)融合交叉的前沿研究,主要是根据碱基性质来进行信道转移概率建模,简单来说,我们是根据“简并碱基”的存储特性,提出具有“软判决”思想的强纠错算法,以期在更低的测序深度上实现信息的无错读取,来充分发挥简并碱基的技术优势。


硕士期间的研究经历,也让我更真实且充分地认识到科学研究的复杂和严谨性。比如,充分的背景调研以及对所使用的工具建立完整的认知,才会对错误产生的原因有充分的认识,才能产生精细准确的分析结果;而一些小的疏漏或者背景知识的欠缺可能会引起一系列的错误和失败。而在实际科研过程中,我时常屡屡受挫。 面对这种情况,我也只能不断地去调整和优化自己做科研的态度和心态。尽可能减少失败以及其负面情绪所带来的内耗,而是明确原因、总结规律、优化调整再出发。


研究是对未知领域和未知世界的一种探索,会使人向往和激动。基因组所涵盖多个研究中心和技术平台,科研水平一流,实力强劲,且其中部分研究方向与生物信息学密切相关。因此,到基因组所读研对我是一件很有吸引力的事情。在基因组所读研期间,我充分感受到了大家对科研的热情,比如我们课题组曾举行过每周课题交流活动,全组人员都十分积极地响应并参与其中,来介绍自己课题中背景知识和难点问题,或者讲解近期读到对课题有帮助地文献。总的来说,基因组所全体人员共同打造出了所内持续、开放、互助地科研氛围,大家也十分乐意在互帮互助中共同进步。


未来,我会不断查漏补缺,注重知识积累,在生信的的道路上闪出些微自己的光火。我一直相信,前路漫漫,行则将至;行而不辍,未来可期。



新时代,农村是充满希望的田野,是干事创业的广阔舞台。基因组所深圳研究生院始终牢记习近平总书记的嘱托和要求,继续以立德树人为根本,以强农兴农为己任,建立“组学特色”课程体系,开设“转录组学”、“表观遗传与基因组学”、“合成生物学”等优势课程,将研究生培养与研究所重大任务相结合。联合巴马院、鲲鹏院,努力办好三个国家级科技小院,培养更多知农爱农新型人才,着力增强研究生发现问题、解决问题的能力和实践创新能力,为全面推进乡村振兴,加快农业农村现代化步伐,为加快建设农业强国作出更大贡献。