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国内合作机构

  基因组所牵头成立了国家农业科技创新联盟,联盟成员由中国农科院、中国科学院、中国热带农业科学院、中国水产科学研究院等国家级研究院所,北京大学、中国农业大学等高等院校,十多个省级农科院,先正达公司、大北农集团等农业龙头企业,共近100家单位组成,协同开展农业基因组科技创新;开展农业基因组相关产业发展重大问题调研。

  基因组所利用先进的组学新技术方法和高性能的大数据分析能力,与国内外优势机构合作,与联盟成员单位共同攻克基因组学上的瓶颈。目前已经与中国农业科学院蔬菜所、果树所、植保所,中国科学院,云南师范大学等多家联盟单位测序近100种农业物种,积累数据量5PB。在组学技术,生物遗传、进化、入侵机制,植物、动物育种等基础研究方面取得了重大成果,发表高水平论文(IF>10)20多篇。3项成果入选2019中国农业科学十大重大进展,1项成果入选2019中国生命科学十大进展。

 

序号

合作单位

合作方向

发表期刊

发表时间

1

华大基因等

植物祖先陆地化进化机制

Cell

2019

2

中国科学院等

单碱基基因编辑技术优化

Nature

2019

3

中国科学院等

开发GOTI基因编辑技术

Science

2019

4

华大基因等

植物多样性进化

Nature

2019

5

北京市农林科学院、中国农科院果树所、蔬菜所、青岛农大等

甜瓜基因组变异图谱

Nature Genetics

2019

6

北京市农林科学院、中国农科院果树所、蔬菜所、青岛农大等

西瓜全基因组变异

Nature Genetics

2019

7

云南师范大学等

马铃薯自交衰退的遗传基础

Nature Genetics

2019

8

鹏城实验室等

第三代基因组测序算法

Nature Methods

2019

9

中国科学院、中国农科院油料所、中国农大等

蓖麻基因组学

Nature Communications

2019

10

广东省农科院蔬菜所、蔬菜所、青岛农大等

瓜类基因组研究

Nature Communications

2019

11

中国农科院植保所、浙江大学、西北农林等

苹果蠹蛾基因组

Nature Communications

2019

12

中国农科院植保所、华南农大等

薇甘菊基因组

Nature Communications

2019

13

中国农科院蔬菜所、华中农大等

番茄代谢组

Cell

2018

14

国际水稻所、华大基因、中国农科院作物所等

水稻基因组

Nature

2018

15

中国农科院棉花所,武汉大学等

棉花基因组

Nature Genetics

2018

16

云南师范大学等

马铃薯二倍体育种

Nature Plant

2018

17

云南师范大学等

马铃薯基因组

Nature Genetics

2018

18

中国农科院蔬菜所、华中农大等

番茄基因组

Science

2017

19

中国科学院遗传与发育生物学研究所等

水稻基因组

Nature Plants

2017

20

昆明理工大学、同济大学等

灵长类动物表观组

Cell research

2017

21

中国科学院北京基因组学研究所等

基因组学技术方法

Nature Communications

2017