科研进展| 基因组所合作找回番茄驯化时丢失的耐盐基因

　　人口的增加对农业资源的高效利用提出了更高的要求。据统计，全球盐碱地的面积高达9.56亿公顷，提高作物的耐盐性是解决粮食安全问题的重要途径之一。番茄是主要蔬菜之一，起源于南美洲安第斯山地区，当地野生醋栗番茄能够在较高盐胁迫环境下生长。然而，在驯化和育种过程中，人类更关注其果实大小，丢失了野生番茄的耐盐基因。

　　近日，中国农业科学院（深圳）农业基因组研究所黄三文研究员团队与中国科学院上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究员团队合作研究发现了丢失的番茄耐盐基因SlHAK20，研究成果在线发表于权威学术期刊《The EMBO Journal》。

　　在这项研究中，研究团队测定了369份番茄材料根系和地上部分的钠、钾离子含量，发现根中钠钾离子比在醋栗番茄、樱桃番茄和栽培番茄三个群体中逐次提高，且与果实重量成正比，这表明驯化过程中番茄耐盐性降低很可能选择更大果实相关。通过全基因组关联分析发现了一个离子转运蛋白基因SlHAK20。SlHAK20具有钠离子转运活性，基因组分析表明此基因受到了强烈的驯化选择，基因编码区的一个6个碱基的缺失导致了栽培番茄耐盐性的显著降低。

　　研究还发现，敲除水稻中SlHAK20的两个同源基因OsHAK4和OsHAK17会导致水稻对盐胁迫敏感，这意味着在单、双子叶作物中SlHAK20同源基因应答盐胁迫的功能是保守的。打破小果基因与耐盐基因的连锁是下一步育种的方向，该研究将为耐盐作物的育种提供新的技术方案。

　　　　番茄的果实选择伴随着其耐盐性降低是由根系中钠钾离子比升高导致的，与根系钠钾离子比关联的钠钾离子转运体编码基因SlHAK20中一个受驯化的变异位点介导栽培番茄耐盐性的降低。

　　文章链接：https://www.embopress.org/doi/pdf/10.15252/embj.2019103256