Yubo Zhang

　　Yubo Zhang研究员

　　中国农业科学院（深圳）农业基因组研究所

　　深圳市大鹏新区鹏飞路7号 邮编：518124

　　Email: ribbon_001@163.com

　　出生时间：1978年6月10日

　　出生地点：湖北

 

　　学习经历

　　2004.9-2007.7     中国科学院水生生物研究所，获博士学位

　　1993.9-1996.7     华中农业大学动物科学技术学院，获硕士学位

　　1989.9-1993.7     华中农业大学动物科学技术学院，获学士学位

 

　　工作经历

　　2015.12-至今         中国农业科学院（深圳）农业基因组研究所　　研究员，创新团队首席科学家，博士生导师

　　2016.10-至今         中国农业科学院（深圳）农业基因组研究所　　测序中心主任

　　2017.1-至今           深圳中农京跃生物技术有限公司　　                 总经理

　　2013.4 – 2016.5     美国国立卫生研究院（NIH）　　                     Research Fellow

　　2011.1 – 2013.3     劳伦斯伯克利国家实验室（LBL）　               　Post-doctoral Fellow

　　2008.1 - 2011.1     新加坡基因组研究院（GIS）　                      　Post-doctoral Fellow

 

　　Yubo Zhang研究员致力于三维基因组技术研发、三维基因转录调控网络解析及非编码DNA调控元件对基因转录调控过程的研究。他共发表SCI论文21篇，SCI他引1058余次。发表通讯或共同通讯作者SCI论文6篇（含SCI 4篇，中文核心2篇），包括6篇ESI高被引论文，单篇最高SCI他引630次，论文累计影响因子为121.6。获发明专利7项，其中授权1项。研究成果还被干细胞参考书网站收录为参考文献（http://www.stembook.org/node/3443）。

　　他担任Global Journal of Animal Sciences and Medicine、Animal Models and Experimental Medicine、中国草食动物杂志编委以及Bioinformatics等多家杂志的审稿人，受邀在《中国生物化学与分子生物学学报》、《遗传》、《Cell Biology and Toxicology》等杂志撰写综述论文，多次在国内外重要学术会议作主题和大会报告，同国内外不同实验室建立了合作关系，包括中国科学院，上海交通大学，美国国立卫生研究院（NIH），麻省理工（MIT），斯坦福（Stanford University），意大利米兰比可卡大学（University of Milano-Bicocca）和法国波尔大学（University of Bordeaux）等不同研究机构的研究人员，推动三维基因组学在动物遗传育种领域的应用。

 

　　所获荣誉

　　2018年 广东省重大人才工程科技创新领军人才

　　2018年 深圳大鹏“鹏程优秀专家”

　　2016年 深圳市海外高层次B类人才

　　2016年 Distinguish Scientist Award, NIH-CSSA

　　2015年 深圳市国家级领军人才，生命科学

　　2015年 中国农业科学院青年英才计划，生物化学与分子生物学

　　2010 年 Special Award. Genome Institute of Singapore

　　2009年 Special Award. Genome Institute of Singapore

　　

　　部分论文†: 通讯作者

　　1. Yubo Zhang, Chee Hong Wong, Ramon Birnbaum, Guoliang Li, Rebecca Favaro, Chew Yee Nyan, Eunice Tai, Joanne Lim Hui Ping, Huay Mei Poh, Fabianus Hendriyan Mulawadi, Silvia Nicolis, Nadav Ahituv, Yijun Ruan and Chia-Lin Wei. Dynamic chromatin connectivity maps reveal lineage specific regulation. Nature. 2013, 504, 306-310.

　　2. Siyuan Kong. Yubo Zhang †. Deciphering Hi-C: from 3D genome to function. Cell Biology and Toxicology. 2019, 35(1):15-32.

　　3. Yanling Peng, Yubo Zhang †. Enhancer and super-enhancer: Positive regulators in gene transcription. Animal Model and Experimental Medicine. 2018, 1:169-179.

　　4. Yubo Zhang. 三维基因组学与精准生物学. 中国生物化学与分子生物学报, 2018, 34(4): 351-363.

　　5. Kamada R*, Yang W*, Zhang Y*, Patel MC, Yang Y, Ouda R, Dey A, Wakabayashi Y, Sakaguchi K, Fujita T, Tamura T, Zhu J, Ozato K., Interferon stimulation creates chromatin marks and establishes transcriptional memory. Proc Natl Acad Sci., 2018, 115(39): E9162-E9171. (*：共同一作)

　　6. Yubo Zhang，甘小妮，何舜平. 线粒体D-loop序列变异与东方鲀属鱼类系统发育. 水生生物学报, 2009. 33 (4): 656-663.

　　7. Yubo Zhang, 何舜平. 细胞色素b和12S rRNA基因序列变异与东方鲀属鱼类系统发育. 科学通报, 2007, 52 (21): 2507-2516.

　　

　　专利

　　1. Yubo Zhang，朱秀生，黄雷，李清；一种活性增强子筛选载体及其构建方法，2019，专利申请号为：201910529227.8

　　2. Yubo Zhang，朱秀生，黄雷，李清；一种基于随机序列利用载体筛选活性增强子的方法，2019，专利申请号为：20190529253.0

　　3. Yubo Zhang，付亚娟，徐波，王帅；一种精准获得全基因组范围内结构变异的方法，2018，专利申请号为：201811546406.4

　　4. Yubo Zhang，孔思远，张高林，范磊，黄其通，李清，黄雷，彭艳玲；一种消除三维基因组学技术噪音的方法及应用[P]. 2018，广东：申请号CN201810589919.7

　　5. Yubo Zhang；孔思远，张高林，黄其通，范磊，李清，黄雷，彭艳玲；利用外切酶组合消除三维基因组学技术噪音的方法及应用[P]. 2018，广东：申请号CN201810589904.0

　　6. Yubo Zhang，孔思远，黄其通，李琳，黄雷，白立景，彭艳玲；一种基于少量细胞全基因组染色质高分辨率构象技术eHi-C 2.0，2017，专利申请号为：201710773996.3

　　7. Yubo Zhang，孔思远，黄其通，黄雷，王秋雁，白立景，张高林，钟学优；一种高效的全基因组染色质构象技术eHi-C，2016，专利申请号为：201610995880.X