基因组所在中国农科院“院所结合 两段式培养”模式的整体框架内建立中国农业科学院深圳研究生院（以下简称“深圳研究生院”），开展硕士和博士的培养工作。2020年9月，深圳研究生院正式揭牌办学，在学科发展方面，深圳研究生院实施“生物技术/信息技术+现代农业”战略，聚焦国家重大战略与发展需求，培养我国农业现代化、产业化转型进程所急需的生物农业、智慧农业、食品安全与营养健康等方面的交叉复合型人才。现已开展生物信息学、基因组学、遗传育种等专业硕士生和博士生教学，与荷兰瓦赫宁根大学、比利时列日大学、华中农业大学等国内外知名高校联合培养研究生，目前在读研究生517人，留学生及国际高校联培博士25人，预计到2025年达到3000人的办学规模。

科技处更新于2022年3月