基因组所纪宏超课题组诚聘深度学习工程师

基因组所介绍

中国农业科学院深圳农业基因组研究所（简称“基因组所”）成立于2014年，由农业农村部、中国农业科学院和深圳市政府共同支持建设。基因组所通过整合生物学和大数据科学，来认识与利用农业生物基因组，服务全球农业生产。为此，基因组所成立了组学技术、合成生物学、植物基因组、动物基因组、生态基因组、食品科学等研究中心和相关技术平台。基因组所的长期愿景是致力于通过颠覆性创新来促进全球农业可持续发展，服务于个性化食品供给体系，并提升人类健康水平和农民社会地位！

成立以来，基因组所深入贯彻落实习近平总书记“四个面向、两个一流”指示精神，开展科研自主权改革试点工作，被列为中国农科院现代院所改革的“试验田”，建立了由中国农科院与深圳市主管领导任共同理事长的理事会；组建了1000多人的研究队伍；形成了以组学技术为核心、辐射农业、食品和生态方向的学科体系，获批“岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心”“农业农村部农业基因数据分析重点实验室”等创新载体；在包括Science、Nature、Cell等顶级期刊在内的杂志上发表SCI论文400多篇，以基因组设计育种育成国审、省审新品种30余个，农业基因组学等研究领域占据世界前沿。2019年以来连续三年自然指数排名全国农业类科研院所第一名，多项成果入选“‘十三五’农业科技十大标志性成果”“中国生命科学十大进展”“中国农业科学十大进展”。先后获得“何梁何利基金”奖、“周光召基础科学奖”“深圳经济特区建立40周年创新创业和先进模范人物”“深圳市市长奖”等奖励。

纪宏超课题组介绍

纪宏超，副研究员，2020年毕业于中南大学，理学博士，长期从事代谢组学与蛋白组学、化学计量学与化学信息学、机器学习与深度学习研究。主持国家自然科学基金青年项目、中国博士后科学基金面上项目、深圳市科技创新人才培养（博士启动）项目。以第一作者在Briefings in Bioinformatics, Analytical Chemistry (3篇)等期刊发表论文6篇，担任Journal of Chemical Information and Modeling, Analytical and Bioanalytical Chemistry, Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems等期刊审稿人。

课题组研究方向：

1. 基于深度学习的未知小分子化合物结构与功能预测

2. 高分辨质谱数据解析及化学计量学分析方法

代表文章

1. Hongchao Ji, Xue Lu, Zhenxiang Zheng, Siyuan Sun, Chris Soon Heng Tan. ProSAP: A GUI Software Tool for Statistical Analysis and Assessment of Thermal Stability Data. Briefings in Bioinformatics 2022, 1–13.

2. Hongchao Ji, Hanzi Deng, Hongmei Lu, Zhimin Zhang. Predicting a Molecular Fingerprint from an Electron Ionization Mass Spectrum with Deep Neural Networks. Analytical Chemistry 2020, 92 (13), 8649–8653. 

3. Hongchao Ji, Yamei Xu, Hongmei Lu, Zhimin Zhang. Deep MS/MS-Aided Structural-Similarity Scoring for Unknown Metabolite Identification. Analytical Chemistry 2019, 91 (9), 5629–5637. 

4. Hongchao Ji, Fanjuan Zeng, Yamei Xu, Hongmei Lu, Zhimin Zhang. KPIC2: An Effective Framework for Mass Spectrometry-Based Metabolomics Using Pure Ion Chromatograms. Analytical Chemistry 2017, 89 (14), 7631–7640. 

5. Hongchao Ji, Zhimin Zhang, Hongmei Lu. TarMet: A Reactive GUI Tool for Efficient and Confident Quantification of MS Based Targeted Metabolic and Stable Isotope Tracer Analysis. Metabolomics 2018, 14 (5), 68.

一、招聘岗位

根据团队工作需要，拟招聘：

深度学习工程师1名。

二、应聘条件

1. 具有硕士及以上学位，数学、计算机科学、计算化学相关专业。

2. 以第一作者或共同第一作者发表过SCI论文或计算机会议论文。

3. 熟练掌握一门编程语言，熟练使用深度学习框架（如Scikit-learn，Tensorflow，Pytorch等），同时掌握化学信息学工具包（RDKit，CDK，DeepChem）优先。

4. 具有良好的理解能力和沟通能力。

三、薪资待遇

1. 提供具有市场竞争力的薪资待遇，根据个人情况背景提供税前9k-18k月薪，相关社会保险及公积金按照深圳市有关规定执行。

2. 符合条件的可选择落户深圳市，并且享受深圳市人才生活和租房补贴，具体金额以政府最新规定为准。

3. 提供良好的科研环境和深造学习培训的机会，表现优异可协助推荐到国内外知名科研单位深造学习和开展科研合作。

四、申请方式

申请者请将个人简历（包含教育经历、研究经历、论文发表）以电子邮件形式发送至：jihongchao@caas.cn。

邮件主题和材料压缩文件请注明“姓名_应聘岗位”。

所有应聘材料我们将会严格保密，课题组会在收到申请的3工作日内与初审合格者电话或E-mail联系，安排面试。