祝贺！组学中心荣获深圳青年五四奖章！

　　

近日，

2022年“深圳青年五四奖章”评选结果公布，

基因组所组学技术研究中心荣获深圳青年五四奖章。

（部分获奖名单截图）

“深圳青年五四奖章”是共青团深圳市委员会和深圳市青年联合会联合设立的授予深圳市优秀青年个人及先进青年集体的最高荣誉，旨在树立政治进步、品德优秀、贡献突出的青年典型，反映当代青年的精神品格和价值追求。

本次获奖的基因组所组学中心，团队平均年龄仅有33岁，现有博士28人，硕士10人，本科7人，党员比例达46%，多项研究成果发表在Nature、Cell、Nature Genetics、Nature Methods、Nature Plants、Nature Communications等国际顶级期刊，是一支涵盖“国家优秀青年基金”、农科院“领军人才”“青年英才”“深圳市高层次人才”，并获得“国家优秀青年基金”的优秀集体。

一、扎根深圳，聚集人才

自2014年以来，基因组所迎来一批从事基因组学前沿技术研究的优秀青年科学家，樊伟、阮珏等研究员先后从北京大学、中国科学院、清华大学、美国加州大学、澳大利亚昆士兰大学等国内外知名高校和科研院所来到深圳，组学技术研究中心自此成立。2016年，国际水稻所（IRRI）资深科学家叶国友加入团队并成立课题组。

（阮珏 团队合影）

（叶国友 团队合影）

目前组学中心已从国内外引进45名科研人员，其中博士28人，硕士10人，本科7人，具有正高级职称人员8名。人才引进工作获得深圳市认可，2人获得深圳市国家级领军人才，1人获得深圳鹏程孔雀特聘岗位B类，7人获得深圳市海外高层次人才，8人获得深圳市后备级人才，另有1人获得农业农村部“杰出青年农业科学家”，1人获得农科院“领军人才”，5人获得农科院“青年英才”，1人获得广东省青年五四奖章，1人获得深圳市优秀科技创新人才优秀青年基础研究，1人获得深圳市优秀科技创新人才博士基础研究启动，1人获得2020年度深圳市优秀共青团员。团队成员先后承担国家重点研发计划项目课题（1项）、国家自然基金委优秀青年项目（1项）、面上项目（6项）、青年基金（5项）、广东省基础与应用基础研究青年基金（1项）等支持。中心人才主体支撑了农业农村部农业基因数据分析重点实验室、农业基因组表型分析与利用深圳市重点实验室、中国农业科学院分子生物学专业公共实验室的建设与运行，成果先后入选中国农业科学院2018、2020年度十大科技进展，中国农业科学院2021年度十大重大发现。

二、探索前沿，技术突出

共性前沿技术缺失或落后是制约我国农业发展的一大障碍。组学技术研究中心围绕农业组学技术发展中的关键方向与问题，聚集国内外优秀青年人才，开发完善基因组学、转录组学、代谢组学、宏基因组学、表型组学等测序及分析技术体系，建设以农业生物组学数据为核心的大数据云计算平台。

针对三代长序列组装，在理论上提出了适合高噪音长序列的模糊布鲁因组装图，开发出SMARTdenovo和wtdbg算法，其中wtdbg突破了组装速度落后于测序速度的领域焦点难题，成为三代测序组装的主流算法，还被用来评测最新测序技术 （HiFi-reads）的组装优势。

（wtdbg2发表文章截图）

针对植物基因组组装中的高重复、高杂合和多倍型等技术难题，开发出ALLHiC算法，解决了高重复的性染色体、高杂合二倍体和同源多倍体染色体分型，实现了多倍体分型组装从0到1的突破，为动植复杂基因组项目提供了有效的算法工具和解决方案。

（ALLHiC算法流程和功能模块）

针对DNA/RNA复合结构R-loop的检测难题，开发了具备高分辨率和链特异的R-loop测序技术，首次绘制了拟南芥全基因组 R-loop 动态变化图谱，并揭示了R-loop在细胞重编程过程中的变化规律及调控功能。

上述技术创新成果获得了学术领域的广泛认可。以方法学为主的学术论文发表在Nature Methods、Genome Biology、Nature Plants、Bioinformatics等国内外知名期刊。其中wtdbg的方法学论文（Nature Methods）获评“2020年中国百篇最具影响国际学术论文”、“Springer Nature出版社 2020 年度生物医学领域中国科研高影响力论文”、“2020年度中国生物信息学十大进展”。

三、服务农业，成果显著

良种繁育是农业发展的重要环节，其核心便是种质资源的创新与利用。因此，种质资源基因组的深入解析是加速育种进程的重要基础与支撑。团队利用自主研发算法完成多个重要农林作物的基因组学研究，对3000份水稻重测序分析阐述优良性状相关的基因；完成重要林木植物榕树基因组并揭示其性别决定和演化；构建高质量龙井43和铁观音茶树基因组揭示茶树演化和驯化历史；完成首个同源多倍体甘蔗染色体水平组装；完成入侵物种薇甘菊高染色体水平的参考基因组的构建并揭示了薇甘菊在全球入侵过程中的环境适应性进化和快速生长的分子机制；为“优薯计划”提供技术指导。相关学术成果发表在Nature、Cell、Nature Genetics、Nature Communications等国际期刊发表论文数十篇，多项研究成果先后入选“2019年度中国农业科学重大进展”“2020年度中国生物信息学十大进展”“2020年中国植物科学若干领域重要研究进展”“中国农业科学院2021年度十大重大科学发现”“2021年度中国生命科学十大进展”。

作为研究所重要的技术支撑，承担基因组所超算平台的运行，目前超算平台计算能力500TFLops，存储能力17PB。与中国科学院遗传发育研究所、华南农业大学等数家单位组建国家农业基因组科技创新联盟单位，协同进行农业基因组核心关键技术攻关，在独脚金内酯调控机制、茶树基因组、薇甘菊基因组、优薯计划等研究中取得了重大进展。

四、不忘初心，圆梦组学

中心45名科研人员，平均年龄33周岁，党员比例46%。支部建在中心上，2019年4月中心成立科研党支部，组织学习习近平新时代中国特色社会主义思想，开展“不忘初心、牢记使命”主题教育，以组学技术研究为本、以国家“粮食安全"重大需求为导向，持续开展具有自主知识产权的技术研发工作。其中阮珏研究员荣获第二十一届“广东青年五四奖章”，刘海琳博士荣获“2020年深圳市优秀共青团员”。